幼い頃に両親を事故で亡くし、幼なじみのテソン(カン・ヒ)の家に引き取られたへボム(オク・ジヌク)が主人公となる「冬すぎて桜」。同じ年ながら家でもほとんど会話を交わすことがなかった2人が、高校3年生で初めて同じクラスになったことをきっかけに本当の気持ちを解放し、友情を越えた関係で結ばれていく様子が丁寧に綴られていく。

へボムは心優しく笑顔を絶やさない一方で、居候の身という状況に引け目を感じ、常に周囲に負担をかけまいと遠慮がちな日々を送ってきた。学校でも友達はなく、同級生のパシリにされる有り様だった。それでも「卒業するまでの我慢だ」と笑顔で耐えるへボムがいじらしい。

もう1人の主人公・テソンは、成績優秀でスポーツ万能、高身長でルックスも最強...という、学校でも女子たちの熱い視線を一身に集める存在だが、本人はクールで無口。そんなテソンに嫌われていると思い込んでいるへボムは、家でも彼を避けながら過ごしてきた。

だが、同じクラスになってへボムが同級生にいじめられていることを知ったテソンは、激昂。それまで抑えてきたへボムへの特別な感情を抑えきれなくなる。